По-перше, вихлоп відпрацьованого повітря відбувається в те ж приміщення, де йде прибирання, і струмінь повітря, що виходить з пилососа, піднімає дрібний пил з підлоги і меблів.
По-друге, відбувається неповна фільтрація відпрацьованого повітря. Навіть найдорожчі фільтри не здатні затримати найдрібніші частки кухонної кіптяви, тютюнового диму, лусочок шкіри, продуктів життєдіяльності пилових кліщів, мікрочастинок від книг і газет. Щоб усунути проблему неповної фільтрації, кількість фільтрів доводять до 5-9. А щоб прогнати повітря через всі ці фільтри, доводиться істотно збільшувати і потужність двигуна. Ця обставина в поєднанні з необхідністю періодичної заміни великої кількості фільтрів збільшує вартість пилососа, але абсолютно "здоровим" вихлоп все одно не стане. Крізь сито фільтри, що уловлюють (при перших прибираннях) близько 99,7% пилу, все одно просочується пил розміром менше 0,3 мікрона. Саме вона містить багато небезпечні складові.
Після прибирання зважена в повітрі пил осідає на колишнє місце зі швидкістю 0,2—0,5 м на добу, а основний пиловий фон зависає на висоті близько 1 м від підлоги — якраз на рівні, де ми спимо і де грають діти. Цього недоліку не позбавлені і пилососи з водяним фільтром. Якщо під час прибирання водяний фільтр пропускає частину води (а той або інший відсоток втрат неминучий), то в прибране приміщення через вихлоп надходять найдрібніші краплі забрудненої рідини, в якій розмножуються мікроби, та ще при її висиханні на поверхні залишаються тверді частинки бруду і пилу. Показники неповноти фільтрації можна оцінювати по-різному, але одне безсумнівно: в тій чи іншій мірі вона має місце і сприяє розвитку алергії, астми і пов'язаних з ними захворювань.
По-третє, переміщення пилососа, нехай навіть забезпеченого найкращим шасі, дещо проблематично, особливо якщо доводиться прибирати приміщення, розташовані на різних поверхах.
